手術室凈化工程凈化系統是創造潔凈手術室的一種設備，無論它多么先進;因層流系統并無消毒滅菌之功效，手術室凈化工程凈化其"無菌(意思:沒有活菌)"環境主要是通過空氣的"過濾"、"層流"以及室內維持"正壓"狀態來維持的。(1)進入手術室必須更換洗手衣褲、鞋帽。(2)嚴格控制（control)入室人數。(3)盡量減少手術室的開門次數與時間(更不可將門打開不關)，維持"相對密閉狀態"，以防外來污染的進入。(4)手術前用酒精"擦拭(cleanse) "室內物品、醫療程儀器（appliance）、設備等。(5)術后及時、徹底（thorough)清潔室內所有物品、墻壁及地面。(6)婦女不可用粉、頭發噴霧劑和指甲油之類的化妝品，以減少污染來源。(7)工作服應選用不易產生靜電(是一種處于靜止狀態的電荷)、不易脫落纖維的滌綸和尼龍織物。(8)定期檢測層流系統功能狀態，測試（TestMeasure)手術室凈化工程凈化環境空氣潔凈度指標（target aim)和特殊結構:莢膜、鞭毛、菌毛（fungus)培養等。

      總之，使用手術室凈化工程過程中，強化無菌（fungus)(意思:沒有活菌)觀念和正規化管理仍然是醫療程安全的根本保證與要求，仍然是手術室工作之根本、之重點，只有當兩者緊密結合起來才是趨于完美的。